Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SypQ62277 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SypQ62277 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SypQ62277 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SypQ62277 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SypQ62277 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SypQ62277 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SypQ62277 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SypQ62277 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SypQ62277 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SypQ62277 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SypQ62277 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms