Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm5dQ62240 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm5dQ62240 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5dQ62240 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm5dQ62240 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms