Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf1Q62187 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf1Q62187 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms