Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3bQ62141 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sin3bQ62141 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms