Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ecm1Q61508 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ecm1Q61508 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ecm1Q61508 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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