Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PcolceQ61398 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PcolceQ61398 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcolceQ61398 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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