Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tcf12Q61286 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf12Q61286 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms