Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc1Q61056 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc1Q61056 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms