Protein–RNA interactions for Protein: Q61037

Tsc2, Tuberin, mousemouse

Predictions only

Length 1,814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc2Q61037 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsc2Q61037 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsc2Q61037 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms