Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxg1Q60987 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Foxg1Q60987 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms