Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Meis1Q60954 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Meis1Q60954 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Meis1Q60954 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms