Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik1Q60934 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms