Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vdac1Q60932 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vdac1Q60932 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms