Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbpQ60925 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbpQ60925 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms