Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurod1Q60867 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod1Q60867 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms