Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf8Q60846 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms