Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2cQ60772 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms