Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr2f1Q60632 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms