Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf123Q5XPI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf123Q5XPI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms