Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp20Q5XG71 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp20Q5XG71 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp20Q5XG71 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms