Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a3Q5XF89 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a3Q5XF89 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp13a3Q5XF89 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp13a3Q5XF89 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp13a3Q5XF89 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms