Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc5a6Q5U4D8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms