Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scaf1Q5U4C3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf1Q5U4C3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms