Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim38Q5SZ99 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim38Q5SZ99 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim38Q5SZ99 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim38Q5SZ99 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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Trim38Q5SZ99 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim38Q5SZ99 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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Trim38Q5SZ99 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trim38Q5SZ99 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim38Q5SZ99 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trim38Q5SZ99 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim38Q5SZ99 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trim38Q5SZ99 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Trim38Q5SZ99 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Trim38Q5SZ99 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Trim38Q5SZ99 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim38Q5SZ99 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim38Q5SZ99 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim38Q5SZ99 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim38Q5SZ99 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim38Q5SZ99 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim38Q5SZ99 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim38Q5SZ99 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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