Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Med13Q5SWW4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med13Q5SWW4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms