Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NacadQ5SWP3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NacadQ5SWP3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
NacadQ5SWP3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms