Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mks1Q5SW45 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms