Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms