Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trdv4Q5R1A3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv4Q5R1A3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms