Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rtp3Q5QGU6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtp3Q5QGU6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms