Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim58Q5NCC9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim58Q5NCC9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim58Q5NCC9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms