Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf2Q5NC05 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms