Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp13Q5BKP2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp13Q5BKP2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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