Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme2Q56A04 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eme2Q56A04 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms