Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CenpjQ569L8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms