Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prune2Q52KR3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prune2Q52KR3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms