Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Herc2Q4U2R1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc2Q4U2R1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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