Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Shank3Q4ACU6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shank3Q4ACU6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms