Protein–RNA interactions for Protein: Q402U7

Prss44, Serine protease 44, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss44Q402U7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss44Q402U7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prss44Q402U7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms