Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Carmil2Q3V3V9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Carmil2Q3V3V9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carmil2Q3V3V9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms