Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1B8

Gal3st4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st4Q3V1B8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gal3st4Q3V1B8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gal3st4Q3V1B8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms