Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp48Q3V0C5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp48Q3V0C5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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