Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc160Q3UYG1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms