Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E330034G19RikQ3UWX6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms