Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syndig1lQ3USQ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syndig1lQ3USQ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms