Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwa5b2Q3UR50 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vwa5b2Q3UR50 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwa5b2Q3UR50 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms