Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms