Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc4Q3UP44 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nhlrc4Q3UP44 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms