Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem253Q3UNB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Tmem253Q3UNB8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Tmem253Q3UNB8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem253Q3UNB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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