Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl2Q3UMU9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms